Les fonctionnalités natives d'OfficeScan sont installées avec OfficeScan et peuvent être activées par les administrateurs à partir de Plug-in Manager. Certaines fonctionnalités, telles que Trend Micro Virtual Desktop Support, sont gérées depuis Plug-in Manager tandis que d'autres, telles que la protection des données OfficeScan, sont gérées depuis la console Web OfficeScan.