電腦效能降低：為了執行工作，間諜程式/可能的資安威脅程式常需要大量的 CPU 和系統記憶體資源。

因 Web 瀏覽器引起的當機事件增多：廣告軟體等特定類型的可能資安威脅程式，通常會在瀏覽器框架或視窗中顯示資訊。視這些應用程式中的程式碼與系統處理程序之間的互動方式而定，可能的資安威脅程式有時可能會造成瀏覽器損毀或凍結，甚至可能需要重新啟動電腦。

使用者效率降低：由於需要關閉經常出現的快顯廣告以及處理惡作劇程式造成的負面影響，使用者無法專心進行主要工作。

網路頻寬降級：間諜程式/可能的資安威脅程式通常會定期將收集到的資料，傳輸給在網路上（或網路之外）執行的其他應用程式。

損失個人和公司資訊：間諜程式/可能的資安威脅程式並非只收集網站使用者瀏覽清單這類無害的資料。間諜程式/可能的資安威脅程式也會收集使用者憑證，例如用於存取線上銀行帳號和企業網路的憑證。

承擔法律責任的風險提高：如果您網路上的電腦資源遭綁架，駭客可能會利用您的用戶端電腦對網路之外的電腦發動攻擊或安裝間諜程式/可能的資安威脅程式。如果您的網路資源牽涉到這類活動，則可能導致您的組織必須對其他人所造成的損害負起法律責任。